SEO/BirdLife ha trabajado en temas diversos relacionados con la contaminación marina y su efecto sobre las aves.
Durante el accidente del Prestige, la organización tomó parte activa organizando un sistema de recogida de aves en playas en parte de la costa gallega, y elaboró un informe sobre el impacto general del accidente sobre las aves marinas. Actualmente se ha implementado un programa de seguimiento de aves orilladas en playas, en el marco del proyecto Interreg FAME, en el que se muestrean mensualmente 14 tramos de 10 kilómetros de playas en la franja atlántica ibérica, y se realizan necropsias a todas las aves recogidas, para evaluar niveles de contaminación y causas de mortalidad. Asimismo, se recoge información sobre el grado de incidencia de hidrocarburos en aves vivas. Se estudia asimismo la posibilidad de evaluar la incidencia de otros contaminantes, especialmente la presencia de plásticos en contenidos estomacales. El enganche con plásticos también se ha estudiado aprovechando observaciones directas en campañas oceanográficas.
