El chotacabras egipcio se reproduce en hábitats desérticos y semidesérticos, con frecuencia cerca de las escasas fuentes de agua.
En invierno ocupa también áreas con cubierta vegetal dispersa.

Como el resto de chotacabras, se alimenta principalmente de insectos (escarabajos, polillas, dípteros…) que captura en vuelo con su enorme cavidad bucal, ensanchada por las vibrisas que contribuyen a aumentar la superficie de captura. Ocasionalmente también atrapa sus presas en el suelo.

No construye un verdadero nido, realiza la puesta en una pequeña depresión del terreno, rodeada de piedras y material visualmente disruptivo, convenientemente elegida para el perfecto mimetismo tanto de huevos como de pollos y adultos. La puesta es de 1 o 2 huevos, incubados casi en exclusiva por la hembra, durante 17-18 días. Los pollos a los pocos días de la eclosión ya deambulan por el entorno del nido y realizan sus primeros vuelos con unas cuatro semanas.

Existen dos subespecies, la nominal Caprimulgus aegyptius aegyptius y C. a. saharae, esta última es la observada en España una sola vez.

La subespecie saharae se reproduce en el interior del norte de África: Marruecos, Argelia y Túnez, y ocasionalmente en el noreste de Libia y Egipto.
Inverna en el oeste del Sahel: Mauritania y Mali.

Una cita homologada de chotacabras egipcio, marzo de 2007, en Pájara, Fuerteventura. Se encontró un macho de la subespecie saharae, exhausto, que fue recuperado y liberado al día siguiente, anillado.
Como ocurre con otras aves ocasionales de Canarias, su observación tuvo lugar tras un episodio de fuerte calima, en plena migración prenupcial de la especie.